Книга Метро 2034 намного дальше шагнула, чем ее предшественник. Спустя год после событий Метро 2033 мы еще раз погружаемся в темный и опасный мир Московского Метро, полного людей, изо всех сил пытающихся отбиться мутантов и болезней. Охотник, сталкер, который вновь появляется даже при том, что все похоронили его, когда он не вернулся из северных туннелей ВДНХ. Он намного изменился, потому что так же, как и Артем, нашел истинную природу черных покрытых кожей существ.
Угроза появилась на станции по имени Тульская. Смертельная болезнь. Она становится серьезной, поскольку все станции метро связаны между собою туннелями, и эта болезнь может распространиться через целую систему. Убить всех оставшихся в живых. Охотник решает принять меры и приложить все усилия для спасения жителей метро, когда он сталкивается с этой проблемой. «Убейте всех, у кого есть болезнь». Он не единственный, у кого появляется эта идея, и он с остальными людьми из станций, пытается изолировать эту угрозу.
Охотник, пытается бороться со своими чувствами, и помогают ему в этом старик и молодая девочка. Его знакомые видят, что Охотник становится измученным жаждой крови, но они также знают и то, кем он был прежде, человек, который спас людей вместо того, чтобы только убить их. Молодая девочка полагает, что фатальный карантин не ответ на уничтожение вируса и берется за поиски медицины, которая может помочь. Когда она обнаруживает способ излечить людей, гонка начинается с финишной черты, являющейся станцией Тульская. Кто станет первым и чье решение проблемы будет более эффективным?